Bütün cisimler moleküllerden meydana gelir. Molekül, bir maddenin, kendi başına bulunabilen en küçük miktarıdır; böyle olmakla beraber, maddenin bütün özelliklerini taşır. moleküller, hemen hemen her zaman atom gruplarından meydana gelir; soy gazlarda olduğu gibi, bir atomluk moleküllerde vardır.
Bir molekül’deki atomun çeşidi kadar, sayısı, düzeni de cismin kimyevi özelliklerine etki yapar. Karbon, hidrojen ve oksijen atomlarının, çeşitli oranlarda bir araya gelmesiyle kimyevi bileşikler, alkol, aspirin, asit karbonik, gliserin, şeker ve sirke gibi birbirinden pek farklı maddeler olarak ortaya çıkar.
Katı cisimlerde, moleküller bir titreşim hareketi yapabilir; ama, aralarındaki çekim kuvvetinin çokluğundan ötürü ayrı ayrı yer değiştirmez.